宋明理学，鬼神新解，用“气神”说解释“神仙”说
道教和道家学者都喜欢讲“神仙”。理学受道家思想影响很深，但可以批判地看待。一般来说，新儒家不相信有神仙可以随意变化，但相信有一个保形、炼气、延寿的道理。程、朱等科学家也相信视听超常，在感应之前就知道，甚至离开灵魂的外壳。下面分别讨论。
理学家张载对道家的神仙说不屑一顾，认为是“谬误”，但他并不确定什么。他说:“不可知者谓之神，荒谬者谓之神与人。”(《正梦神化》)
程否定道家的长生不老、白日飞升说，肯定道家的保形炼气、延年益寿说。“问:‘什么是童话？’“我不知道怎么会这样。如果你说你在白天飙，那也没什么。如果你住在山里，保持体形，炼气延寿，是有的。”(《遗书》卷十八)从现代科学的角度来看，住在山里，空气清新，负氧离子，可以增强人体细胞的活力。以及远离世俗，无忧无虑的事情，再加上体育锻炼，呼吸，保持人与自然的原始平衡等。，这些都符合健康之路，有利于延长人的寿命。
程颐也认为，打坐炼气，功夫深了之后，就可以知前了。“问:‘中国以外的人来看他。“什么是先知，”说:‘是的。我倒想看看宋山东吴京这样做。“问:‘我怎么能？说‘冷静就好，然后就可以拍照了。”(《遗书》卷九月十八)
程子所谓的炼气，就是今天所谓的气功，但在古代它被称为引导，实际上是一种随着身体运动的腹式呼吸，这种方法有着古老的传统。《庄子·刻意》说:“呼吸，吐故纳新，熊伸通鸟为寿。此导者，养身之人，亦彭祖寿之宠也。”《抱朴子杂英篇》也讲了一些引导动作，如“龙引虎，熊过龟喉，燕弯蛇，鸟伸”。很可能，古代人崇拜动物的特性，如敏捷、冬眠和长寿。经过长期观察他们的生命心智，编出各种仿生动作，通过内力的修炼和控制，达到养生的目的。理学对道家的修静炼气功夫有相当的理解。朱还对道教经典《周易参同契》进行了评论。
道家关于内丹(气功)的理论书籍可以说是铺天盖地。然而却被视为千百年都不会流传的秘密。修行人有“半张纸是真，五本书是假”的说法。其实气功的本质就是精神和气的和谐。《老子》里的那句“持营精神而抱一，能无之而生”就足够概括了。所谓营，就是魂，灵，灵，拥抱一个就是合一。修行时，心(神)专注于气在腹部的运动，即达到“炼气”的目的。所以朱向指出:
“养生人说千言万语，说龙说虎，说铅说汞，说坎说离，如此而已。老话说‘你能扛得住你的灵魂吗？‘你生气的时候能像婴儿一样柔软吗？’今天的道教，只是持之于外，懂得所谓‘屏气凝神，不可离去’！”(《斋藤优子语文课》卷八七)
可见朱对道家内丹术有着深刻的理解。
朱以气神论为基础，认为养生家能炼盛强之气，故身死，气不散，徘徊于天地之间，有时出现于天。这就是所谓的成仙，但会持续很久，其气也会消散。朱对说:
“时间长了，精神就会分散。人说神仙不死，辈说一句。汉朝说了一些关于安其生的话，唐朝以后就没人说了。他还说是汉族和人，但现在他已经消失了。可见他只是多了一次生命考验，但最后也散了。”(《斋藤优子流派》，第三卷)
很多道教文献都讲到一种灵魂出窍现象，道教称之为阳神(元神)。阳神本质上是一种气，即阳，真气和元气。道教认为，气功修炼到高级阶段，会像婴儿一样诞生，美丽可爱，从天门(头顶百会穴)出来。刚开始会被观念控制，暂时应该不会很久，也应该不会很远。渐渐的，可以自由闭合了，也就悠远了，四处游荡，自得其乐。朱也信奉道教的阳神显灵说。他说:“蒲城山有一个人，经常在山上烧丹。后来因为日出，我祝他云:‘七日不归，可焚我。’不到七天，那人就把它烧了。之后道士回来，又喊又骂，还能在墙间写字，但墨迹较轻，很快就没了。”(同上)朱是理学家，受道家影响最大，这在他的鬼神观中表现得最为明显。因此，清初潘所说的“朱子道，陆子禅”并非没有根据。
学过神仙家技艺的王阳明，对神仙家并不陌生。但他认为不能轻易讨论。曾经有人问他神仙的事，书上没有回答。后来那人派他哥哥去问，阳明答书，承认自己从小练过法术，但没用。他认为古人有可能活到1500岁，比如广程子，但也不完全是因为功夫的修炼，也有先天之气，非人力所能逼。他还指出，所谓神仙的拔屋拔屋，拔屋拔屋，都是骗人的把戏，都是假象。不可不信:“若说神仙们的拔屋拔屋，拔屋拔屋，拔屋拔屋，拔屋拔仙，尹文子的所谓魔，石的所谓外人。如果你说是，你也有欺骗你儿子的嫌疑。”(同上)
杨明还指出，神仙的艺术不好说，真的要自己去体会。“隐居深山三十年，耳目一新，一心一意，胸中不挂一尘，然后能说此话”(同上)。在阳明看来，所谓神仙，不仅仅是神仙的问题，更是人品境界的问题。无论是成仙还是成佛，也需要一种奉献精神，摒弃庸俗和疲惫的思想，潜心数十年于道。只有这样你才能说有没有神仙。从这个角度来看，人生似乎是一场大“赌”。人真的值得“赌”自己是一个一无所知，一无所有，只有一条命的神仙吗？这是另一个需要首先解决的重要价值问题。
儒家一贯的观点是神仙无所不知，无所不知。但如果人真的懂了处世之道，知道了处世之道，就不一定要成仙了。所以孔子的“未知人，如何治鬼”和“未知生，如何知死”的话，具有永恒的魅力，意味深长，耐人寻味。